肝脓肿会引起败血症。败血症又称脓毒血症，是机体受到细菌、病毒或真菌等明确病原微生物的感染，所致的全身炎症反应。
肝脓肿的病原体主要包括细菌、阿米巴原虫及真菌，其中细菌感染最为常见，约占肝脓肿的80%以上，阿米巴肝脓肿约占10%左右，真菌性肝脓肿则较为少见。
由于肝脏血管丰富，如果肝脓肿没有及时采取抗感染治疗，控制不利时，则病原体会在肝脏大量繁殖，然后通过血管进入到血液循环系统中，从而导致败血症，即脓毒血症的发生。