淋巴管囊肿的症状与淋巴管囊肿的发病部位有很大的关系，存在明显的区别。
例如发生于颈部的淋巴管囊肿，如果对周围形成了压迫，尤其是气管或者食管，病人会出现呼吸困难或者是吞咽困难的症状。对于锁骨上出现了淋巴管囊肿，如果体积相对较大，会引起周围组织压迫，甚至出现肌肉萎缩，影响关节活动的症状。胸腔的淋巴管囊肿还会引起病人的呼吸困难，严重的甚至会造成呼吸衰竭。
目前对于淋巴管囊肿有适应证的，还是建议积极地进行手术切除。但是对于许多淋巴管囊肿，注射治疗也是有效的方式之一。