预防秋季腹泻，首先就是要加强宝宝良好的卫生习惯。因为秋季腹泻多见于病毒感染等传染疾病，所以平时要注意孩子的手卫生。在孩子外出回家、玩过玩具、吃饭前、排便后等，都要及时给宝宝清洗双手，这样才能减少病从口入的几率。
其次，要想预防秋季腹泻，还要注意饮食卫生，尤其是不要吃没有经过清洗以及变质的食物。
再者，大人也要养成良好的生活习惯，注意生活环境卫生。不要在宝宝生活的区域堆积垃圾，以免造成病毒、细菌生长繁殖。
另外，如果在秋季腹泻流行期间，可以根据当地的流行病学情况接种轮状病毒疫苗，能够更好增强孩子抵御疾病的能力，从而降低秋季腹泻的发病率。