多数情况下是不会复发的。
川崎病是一种急性感染性疾病，经过早期的系统规范治疗以后，就能够治愈。没有慢性过程，所以不符合复发这个概念。一般日后多注意预防感染，减少机体免疫应答的前提下，都会避免这个疾病的再次发生，而不是复发。这个疾病如果有再次的出现，是又一次的疾病过程，与前一次发作没有关联性，这个病主要是一种全身中小血管的疾病改变，尤其是冠状动脉的影响。
如果冠状动脉已经恢复，则表明这个疾病的整体恢复比较良好。