两个肾都有囊肿，不要太担心。囊肿一般是良性的病变，极少数是恶性的病变，根据结石的大小可以采取不同的治疗方式。
如果囊肿个数比较小，囊肿直径小于5cm，动态观察不需要特殊处理。
如果囊肿直径大于5cm，压迫了肾脏组织，或者压迫肾动脉、肾盏等，引起高血压或泌尿系统梗阻，需要及时行囊液吸出或硬化治疗。
如果囊肿合并了感染，需要口服或静脉使用抗生素抗感染治疗。
如果囊肿体积比较大，同时有恶变的可能，可以行手术探查术，病变组织取活检送病理，明确具体病理类型。