射精后出现疼痛症状，一般考虑存在精囊炎、慢性前列腺炎、尿道炎等可能。
疼痛的部位往往比较分散，包括了会阴部、尿道口、阴囊、睾丸、腰骶部等处。所以，这个疼痛也可以称之为骨盆疼痛综合征。在炎症状态下，精囊及前列腺、生殖附属性腺本身就处于炎症充血状态。射精过程可以加重局部的充血状态，再加上射精时，盆底肌肉会紧张性收缩，增加了肌肉疲劳感，导致射精疼痛。
另外，尿道炎，尤其是前尿道炎，是精液输出通道，精液在射出的过程中，会刺激炎症尿道，诱发疼痛症状。