儿童流清鼻涕又咳嗽，如果是急性起病，考虑为病毒感染引起的急性上呼吸道感染。对病毒感染通常采用中药治疗，若合并细菌感染，则根据具体的细菌培养和药敏试验结果，选择合适抗菌药物。
对于咳嗽、流涕的症状，可以选用止咳化痰类药物。对于鼻塞者，可以酌情使用鼻部减充血类药物。对于咽喉肿痛患者，可以给予咽喉含片。
儿童流清涕又咳嗽，若症状持续2周或反复发作，且全身症状较轻，可考虑为过敏性鼻炎，治疗上给予抗过敏药物进行治疗。
儿童年龄比较小，治疗时一定要注意药物的使用，家长不要随意给予口服药物，应该在医生指导下进行科学选择。