治疗霉菌性阴道炎主要服用抗真菌类的药物来达到治疗目的，而且针对这类疾病多以局部治疗为主，也可以使用外用抗真菌药物，同时再配合全身抗真菌药物，来达到治愈的目的。
因为霉菌性阴道炎就是俗称的外阴阴道假丝酵母菌病，是由于假丝酵母菌感染而诱发的女性外阴以及阴道炎症。所以在临床中，治疗多选用抗真菌药物来达到相应目的。
其次，霉菌性阴道炎在日常生活中很容易出现反复发作，所以在日常生活中应该进行彻底治疗。患者在治疗期间也需要注意个人卫生，并且避孕性生活。