晨尿颜色深有可能是生理性因素。首先经过一个晚上的休息，因为没有喝水，所以往往会出现尿液浓缩，从而容易导致晨尿颜色比平时加深。这是一种正常的生理现象，不会影响身体健康，不需要特殊处理。
其次，如果患者长期服用维生素B，也会造成尿液颜色发黄，这种情况只需要停用维生素B就可以缓解，也不需要处理。
再者，考虑病理性因素，有可能是肝胆疾病所造成。这种情况对患者的身体健康有害，建议患者及早去正规医院进行检查，然后进行针对性的治疗。