有些蛋白尿比较好治疗，然而绝大部分的蛋白尿都是不好治疗的，因为在临床上引起蛋白尿最常见的病因是慢性肾功能衰竭。蛋白尿通常难以彻底治愈，只能通过积极治疗来降低尿液中蛋白的含量。治疗的关键在于积极保肾治疗，延缓肾脏功能衰竭病情的进展，从而降低尿蛋白。
如果是肾脏的急性炎症所引起的蛋白尿，在积极抗炎治疗后，肾脏炎症逐渐好转，蛋白尿可彻底治愈，但是应该尽早发现、尽早治疗。如果延误治疗，导致病情进一步进展，则可能会出现慢性肾功能衰竭。另外，有些患者蛋白尿是在剧烈运动后出现，这类患者通过充分休息后，蛋白尿可自行缓解并彻底治愈。
患者出现蛋白尿时，应及时到泌尿外科就诊，完善相关检查以明确病因，并针对病因积极治疗，避免病情进展，导致终末期肾病。