睾丸表皮脱皮，应当先明确病变的类型，然后进行针对性的治疗。
如果是阴囊湿疹所引起的睾丸表皮脱皮，引起的临床症状较轻时，可以先不予进行治疗。应当做好睾丸局部皮肤的护理，经常使用温清水进行清洗，保持清洁与干燥，选用棉质透气舒适的内裤。避免长期久坐，不要长期处于高温环境中。如果引起了明显的临床症状，在必要时可使用抗组胺类的药物进行治疗。
如果睾丸表皮脱皮为真菌感染所引起，确诊以后，应当先外用抗真菌的药物治疗，比如氟康唑软膏。必要时还应配合口服药物治疗。