马凡氏综合征引起的症状主要是累及人体的各个脏器，各个系统比如常见的有心血管系统。
会导致先天性的心血管畸形、主动脉根部出现扩张、主动脉瓣膜关闭不全，也可能会出现主动脉夹层动脉瘤、二尖瓣的脱垂、二尖瓣关闭不全等情况的发生。还可能会出现室间隔、房间隔的缺损动脉导管未闭，主动脉缩窄等情况的发生。
也可能会导致眼部的视网膜剥离、高度近视、白内障、虹膜震颤等，骨骼和肌肉系统也是比较经常受累的器官。而肢体会延长、肌肉不发达，会出现鸡胸、漏斗胸、脊柱侧弯等情况的发生。