妊娠合并甲状腺机能亢进的治疗主要包括：如果怀孕之前甲状腺功能亢进，备孕前应该把甲状腺功能调至正常。妊娠期甲状腺机能亢进首选药物治疗，常用的药物是丙硫氧嘧啶和甲硫咪唑。
妊娠剧吐可以导致妊娠期甲状腺功能亢进，一般妊娠12周以后呕吐症状减轻，甲状腺功能可恢复正常，这种情况是不需要治疗的。
一般怀孕早期每1~2周复查一次甲状腺功能；妊娠中、晚期每2~4周检测1次；达到目标值后每4~6周检测1次。一般怀孕早期首选丙硫氧嘧啶治疗，怀孕中晚期可选择甲硫咪唑。