巨大肥厚性胃炎是由于胃黏膜的过度增生造成胃壁广泛增厚引起，而巨大肥厚性胃炎的因素，目前还是尚未明确。
但通过目前的相关研究，通过调查大量的巨大肥厚性胃炎患者，可能与巨细胞病毒或者幽门螺旋杆菌感染有关系，而巨细胞病毒感染最常见于儿童，最常见是母婴传播巨细胞病毒，或者家庭聚集式饮食传染幽门螺旋杆菌。
另外，身体内胃黏液细胞中转化生长因子α水平增加，转化生长因子与表皮生长因子受体结合，可抑制胃酸分泌，也是重要的得病因素。