男子不育不是一个独立的疾病，而是由多种疾病或多种因素造成的一种后果。它的临床症状也是多种多样的。
例如因性功能障碍所造成的不育，临床上可以表现为性欲低下、阳痿、早泄、不射精的表现。
如果是因为生殖道的感染而造成的不育，会常伴有不同程度的尿道刺激症状：尿液浑浊、发黄、甚至尿道有分泌物，还可以出现腰骶部酸痛、会阴部隐痛、睾丸坠胀、疼痛，射精疼痛。
如果因精索静脉曲张而导致的男性不育，多伴有阴囊坠胀不适以及睾丸、腹股沟、小腹部的隐性疼痛。
如果是因精神因素所造成的男子不育，可有长时间的精神紧张、情志刺激、情绪低落、精神萎靡不振、失眠、健忘等。