肛门长了个肉疙瘩很痛可能为血栓性外痔或炎性外痔充血、水肿导致，也可能为肛乳头瘤、直肠息肉或者内痔痔核脱出所引起，患者应及时到医院进行相关检查，明确病具体的原因，对症选择治疗方案。
如果明确为炎性外痔或者是血栓性外痔所引起，可外涂马应龙痔疮膏或肛泰软膏予以治疗，可以起到消肿止痛的作用，通常3-5天可以使肉疙瘩消退。如果药物治疗效果不好，建议及早手术治疗。
如果为内痔脱出应及时用手将痔核回纳肛门内，再配合保守治疗。如果为肛乳头瘤或直肠息肉所引起，应该及时进行手术治疗来进行切除。