溶栓药对脑血栓有效，但是临床上要严格掌握适应症，排除禁忌症的情况下尽早应用，脑血栓患者的溶栓治疗，如果栓子溶开后，可以使脑部血流讯速恢复，从而可能会保护缺血半暗带组织，可以最大限度改善脑细胞功能受损的症状和体征，减少患者的致残率和致死率。
如果发病时间超过6小时或者是年龄大于80岁时，溶栓治疗发生脑出血的风险会明显增加。
临床上常用的溶栓药有阿替普酶、瑞替普酶和尿激酶，阿替普酶和瑞替普酶适用于发病时间在4.5小时之内，尿激酶适用于发病时间在6小时之内。