不适合吃龟鹿补肾丸的人有儿童、孕怀期间的女性，还有感冒患者也不宜服用本品。如果经常有腹胀和便溏，脾胃比较虚弱，经常出现痰多咳嗽的患者也要慎用本药物。
若是自身有一些慢性疾病，比如糖尿病、肾病、高血压、心脏病时，也要在专业的医师或药师指导下使用本品。还有些人可能为过敏体质，在服用龟鹿补肾丸时也要慎用，应先有咨询医师或药师。
服药期间的饮食需要注意，应该吃一些容易消化和好吸收的食物，对过硬、不易消化食物应忌口。