导致喉咙发黄、肿痛的原因主要有以下几种：
首先，可能是由于鼻部疾病造成，比如慢性鼻窦炎症或后组鼻窦炎，容易导致患者有长期的鼻涕回缩。这些脓性分泌物长期、大量地附着在咽喉壁，主要表现出来的就是喉部有淡黄色或脓性的分泌物，所以喉咙发黄，而且容易引起肿痛。
其次，可能是慢性咽喉炎症造成，此类患者咽喉壁根部会存在许多淋巴组织，容易产生淡黄色的分泌物。会在喉咙壁表面附着，一般呈现为发黄的现象，而且在病情发作时容易导致喉咙肿痛。
除此之外，也有可能是肺内感染，或咳黄痰导致的咽喉发黄以及肿痛。