目前新冠肺炎核酸检测的准确率较高，但具体的数据还不明确。
根据目前的数据显示，临床上核酸检测的阳性率是30~50%，核酸检测为阴性的患者有两种原因，一是确实没有感染新型冠状病毒，二是虽然已经感染但是没有被检出，也就是假阴性。
假阴性的出现与多种因素有关，鼻咽拭子采取样本的随机性较高，早期感染仅仅在肺部的边缘，病毒没有在样本中，试剂盒的质量问题，采样之后运输时间和保存条件不合格影响结果，检测结果报告由于解读错误被判断为阴性。