保护心脏的药物应当根据心脏损伤的不同的病因，选用不同的药物。心脏最常见的受到损害的原因就是冠状动脉粥样硬化，可以造成冠脉管腔的狭窄甚至闭塞，可以造成心肌的缺血坏死。此时，应当选用他汀类药物调节血脂，并根据病情选用单联或者是双联的抗血小板药物，防止血栓形成阻塞冠脉。另外，还应当加用扩张血管的药物，如硝酸酯类药物，改善心肌的供血。
由于各种原因造成的心脏的负荷增加引起的心脏的损害，应当选用防止心肌重塑的药物。比如β受体阻滞剂，血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂、转换酶抑制剂、醛固酮拮抗剂等，来防止心肌重塑的发展。
如果是由于心肌炎引起了心脏的损害，则应当积极地抗病毒、抑制炎性反应、抑制免疫反应，来保护心脏，防止心脏的损害。