胆结石发生于胆道系统，可分为胆囊结石和胆管结石。胰腺炎发生于胰腺组织，其发病机制均与感染有关。胆结石的腹痛一般出现在右上腹，胰腺炎的腹痛都发生于中上腹或脐周，两者疼痛发作时，均可放射至肩背部及腰部。
两者的血常规检验都可出现白细胞计数升高，胆结石伴炎症的患者，也可出现血淀粉酶的升高，但升高的情况一般较轻，而胰腺炎时，淀粉酶的升高可在正常量的10倍以上，并伴有尿淀酶的升高。影像学检查中，胆结石可在腹部彩超或ct等中表现出胆道系统的高密度影，而胰腺炎多表现为胰腺周围组织的渗出，可出现毛糙影。