导致生殖器感染的因素有很多，但主要以下面三大类为主。
第一，通过性接触发生感染，生殖器是进行性生活的主要器官，在进行性生活的同时，如果一方性伙伴患有传染性的疾病，就可以通过性接触将疾病传染给对方，而且在性接触的过程中也有可能会导致患者的生殖器黏膜发生损伤，也会导致患者发生生殖器的感染。
第二，在正常的生殖器部位就会存在细菌，如果患者发生抵抗力下降，就有可能导致局部细菌入侵生殖器，发生生殖器的感染。
第三，有些患者可能会进行生殖器的器械检查，女性患者比较多见，在检查的过程中也可能会对生殖器造成损伤，导致患者发生生殖器感染。