扁桃体恶性肿瘤要进行咽喉镜的检查，能够更加清晰的对扁桃体进行观察，对于扁桃体的病变进行早期的判断。
扁桃体恶性肿瘤会在咽部呈浸润性的生长，可以对扁桃体的部位行CT或者磁共振的检查，看见扁桃体恶性肿瘤的大小，对周围组织的侵犯程度进行分析，制定下一步的治疗方案。
对于扁桃体恶性肿瘤的定性检查，需要进行扁桃体肿瘤组织的病理学检查，可以通过手术或者穿刺的方式，取得扁桃体的组织，根据病理的分期决定手术的方式。