需要吃消炎的药物，也可以配合益生菌。
秋季儿童出现胃肠炎，常常是由于饮食不卫生或者肠道病毒感染造成。所以在出现腹泻症状以后，首先要及时化验大便常规，区分感染的性质和程度。诊断明确以后，选择相应的抗生素，常用的有阿莫西林、头孢噻肟钠，或者肠炎宁、炎琥宁进行系统消炎治疗。
治疗过程中，因为存在胃肠道功能紊乱、消化不良，所以可以适当配合益生菌帮助消化，常用的有双歧杆菌、乳酸杆菌等。还要口服补液盐，防止脱水，防止离子紊乱。同时，适当地控制饮食，给予易消化、易吸收的食物，减轻胃肠负担。