甲亢肝功能损害主要采取以下方式治疗：
1.甲亢出现肝功能损害，一部分体现在转氨酶明显升高，严重的患者会增高到3倍以上，这时候需要停止抗甲状腺药的服用，使用碘-131继续治疗。另一部分则表现为胆红素的升高，必要时也需要停用抗甲状腺药物。
2.可适当地使用保肝药，根据不同的肝功损害情况，选择合适的保肝药物，例如护肝片等，定期复查转氨酶的情况。
3.在饮食当中建议多食用新鲜的蔬菜和水果，有利于改善肝功能，避免高脂饮食导致肝功能进一步恶化，同时禁酒。甲亢的患者伴有肝功能损害是本病治疗期间比较常见的问题，具体需要在医师的指导下治疗。