对于真菌性甲沟炎主要考虑是由于指甲剪的过短，或者是其它不注意卫生造成的真菌感染，特别是可能考虑应用大量的抗生素造成菌群失调，还是比较危重，比细菌性的治疗困难，预后也不是太好。
临床则表现为指甲的红肿疼痛以及会出现流脓等，一旦出现还是要积极治疗。建议先进行药物治疗，吃一些抗真菌的，包括内服和外用，之后根据情况必要时要做个手术把指甲去除。
去除诱因之后要按时换药并保持皮肤的清洁干燥，最好不要穿鞋或者是穿拖鞋等，使伤口暴露出来好的会快一点，之后定期复查。