脑灰质异位会发生恶化，尤其是灰质异位越来越严重时。由于灰质异位是先天畸形要根据严重程度及时采取措施。对于脑灰质异位症状比较轻的患者，密切观察并服用药物。如果是难治性脑灰质异位要及时手术治疗。
大脑灰质异位属于癫痫疾病的一种，如果没有得到及时有效的治疗会导致癫痫反复发作，甚至对大脑中枢神经系统造成影响，容易导致宝宝智力低下、智力缺损以及精神疾病等。
为了预防癫痫的发作，在日常生活中要服用抗癫痫的药物，并且多参加体育运动，锻炼身体能够提高身体的抵抗力。