导致咽鼓管不通畅的原因不同，治疗的方法也不同。
比较常见的就是急性炎症，例如急性上呼吸道感染，容易导致局部充血、肿胀，而且还容易引起咽鼓管不通畅。主要是进行抗感染治疗，一般是口服抗病毒药物或抗生素药物，并配合血管减充血剂进行治疗，例如呋麻滴鼻液，能够缓解咽鼓管不通畅的情况。
如果是慢性炎症感染引起的，除了进行抗炎治疗之外，平时也可以做咽鼓管吹张。但如果发生鼓室积液时，一般需要做鼓膜穿刺将积液引流，症状会逐渐缓解。