二价宫颈癌疫苗与四价宫颈癌疫苗覆盖的HPV亚型是不同的。
二价宫颈癌疫苗主要针对HPV16与HPV18两个高危亚型，而四价宫颈癌疫苗在HPV16与HPV18两个高危亚型的基础上，增加了HPV6与HPV11两种低危型亚型。宫颈癌为最常见的妇科恶性肿瘤之一，为女性健康的主要杀手。大量研究数据表明，宫颈癌的发生主要与HPV感染有关。
随着医学技术的发展，也逐渐研究出了宫颈癌疫苗，除了二价与四价外，还有九价的宫颈癌疫苗，其覆盖的HPV亚型更多。