肺动脉段突出最可能的原因是肺动脉压力增高引起，能引起肺动脉压力增高的原因很多，包括特发性肺动脉高压症和其他原因引起的肺动脉高压，特发性肺动脉高压的原因并不是很清楚，其它原因引起的肺动脉压力增高的疾病包括呼吸系统疾病，比如慢性阻塞性肺病、间质性肺病等。
也可能的心脏方面的疾病引起的，比如左心瓣膜病、某些先天性心脏病比如动脉导管未闭、法洛氏四联症等。都可以引起肺动脉压力增高，在胸片上就可见肺动脉段突出，所以，对于肺动脉段突出的状况还应该再做进一步检查，才能明确具体原因的。