尿路感染大肠埃希菌，主要是使头孢菌素类或者喹诺酮类的抗生素进行治疗，比如头孢曲松钠、左氧氟沙星、环丙沙星等，都有不错的治疗效果，当感染严重时还可联合用药。
如果是使用以上药物没有太大的效果，表明致病菌对于以上药物不太敏感，还应做药物敏感试验，选择针对于大肠埃希菌敏感的抗生素类药物进行治疗。
在治疗的过程当中，患者一定要加大饮水量，每天要饮水2000ml以上，多排尿，反复地冲刷尿路，促进细菌代谢产物的排出，也能够防止细菌在尿路当中附着，从而促进尿路感染疾病的康复。