室间隔缺损手术治疗年龄有逐渐提早的趋势。但对有心力衰竭、肺部感染无法控制的婴儿，可考虑行肺动脉环束术，以减少肺血流量，改善心肺功能，至2岁后再行根治术。
一般病例，根据缺损自然闭合90%发生在8岁以前，故宜于学龄前期进行缺损修补术。随着对室间隔缺损的病理解剖，特别是对心脏传导系统的深入了解，手术效果逐年提高。无明显肺动脉高压的患者，手术死
亡率降低到1%以下，预后好，多可恢复正常工作；但对伴有严重肺动脉高压者，手术后并发症多，死亡率在10%左右，一旦治愈，存活率与正常人无异。