囊胚移植的成功率，目前全国的平均水平大约是50%左右。
囊胚移植属于人工生殖的范畴，女性往往患有输卵管炎、输卵管不通畅或者是其他原因导致的不能怀孕，所以采取移植的方法来进行怀孕，移植的成功率与女性的身体健康、功能状态、使用药物调理的效果等，都有着很密切的关系。
当移植了以后，需要在医生的指导下给予相应的药物来维持体内的绒毛膜促性腺激素以及孕酮的水平，要达到一定的数值，否则不利于孕囊的继续发育，容易发生流产，导致移植失败。如果做了移植，5~7天以后，体内的绒毛膜促性腺激素的浓度开始升高，往往提示移植成功。