甲减可以因为进食碘不足，而导致甲状腺肿。比如一些碘缺乏的地方，可能会发生有地方性甲状腺肿，从而导致甲减。
还有使用一些抑制T4合成或者释放的药物，比如锂、硫脲类药物、碘化物等，也可以导致甲减。另外一些导致甲状腺肿的食物以及污染物，都有可能导致甲减。
甲减病因比较复杂，包括原发性甲减和继发性甲减。原发性甲减比较多见，其中自身免疫损伤是最常见的病因。其次为甲状腺的破坏，比如甲状腺切除术后、放射性碘131治疗后，继发性甲减往往比较少见。