判断新冠肺炎还是流感，首先可以从流行病学史加以区分。两者的流行病学史有一定的不同。但当患者未能提供详细的流行病学史时，则需要根据临床症状和相应的辅助检查，进一步的评估和分析。
流感患者多是以全身酸软、乏力、纳差、头痛为主，部分流感患者是可以合并有病毒性肺炎，此时与新冠肺炎的临床症状有重叠之处。新冠肺炎主要是以干咳、发烧、乏力为主，但部分患者症状可以不典型，也难以区分。
故最终的确诊，还是需要早些行相应的病原学检测。例如行新冠病毒和流感病毒的核酸和特异性抗体检测，是可以加以区分和确诊的。
但少数患者可以有新冠肺炎合并流感，此时要加以识别，并同时早期完善相应的病原学检查，予以对应的治疗。