肺结核并不是由支原体感染引起的，肺结核是因为感染了结核分枝杆菌引起的肺部病变，这两种疾病属于完全不同的两种病原体感染，并不会发生联系。
支原体感染通常是不会传染他人的，而肺结核具有很强的传染性，最常见的感染渠道是呼吸道飞沫传播。另外二者在治疗方案上也是完全不同，支原体感染需要抗感染治疗，多采取大环内酯类抗菌药物，而肺结核需要做抗结核治疗。
大多数支原体感染患者经过治疗后都能够取得很好的治疗效果，但肺结核治疗周期比较漫长，而且很难完全治愈。支原体感染除了发生在肺部以外，还有可能感染泌尿生殖系统，而肺结核主要病变都在肺部。