阿米巴肝脓肿是否可以用甲硝唑，要在医生的指导下来选择。有些患者对于抗阿米巴药物，如甲硝唑、替硝唑等敏感，所以可以使用。但有些患者会出现甲硝唑治疗无效，此时则需要选用氯喹类的药物。
除此之外，有些肝脓肿症状严重的患者或药物治疗无效时，需要采用穿刺引流的方式，这样才能把脓肿去除，缓解症状。甚至有些患者经过穿刺引流及药物治疗后都无效，则需要采取外科手术的方式。
当出现阿米巴肝脓肿时，患者要注意休息，及时地补充所需要的营养物质，避免加重病情。