麦粒肿破溃流脓后，一般需要视具体情况进行排脓处理，并结合使用抗生素类眼药水促进病情好转，预防感染。
麦粒肿溃破以后，会有脓水流出，若囊肿较小，破口的面积小，导致脓水外流受阻，在大多情况下，需要专业性无菌操作，将内部脓样病理产物清洁干净，并清创。必要时，还要放置引流条或者切开排脓，以防止脓样物残留。
清除后给予抗生素类眼药水或者眼药膏治疗，帮助创口修复以及防止创口感染。患者应避免自行手动挤压，以免操作不当，或者将病菌传入，加深感染，导致感染扩散。