痛经一般不会导致习惯性流产。但如果痛经的患者有子宫腺肌病或者子宫内膜异位症，这样的患者有可能会发生习惯性流产，但也并不是绝对的。
绝大多数的痛经都是因为患者在月经来潮时，体内的子宫内膜前列腺素含量增高导致的，过多的前列腺素可以引起子宫平滑肌过强收缩，引起血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧的状态，出现疼痛。
痛经一般不会发生习惯性流产，除非患者有生殖系统的病变或者有其它的全身性疾病，如甲状腺功能低下、黄体功能不足、多囊卵巢综合征、高催乳素血症、严重的高热、肝肾功能不全等。