自然流产的发生确实大多是胚胎质量不好而导致的，但是并不是全部都是，有一半以上的自然流产是因为胚胎自身的染色体发生突变而导致的。
但是也有的自然流产的发生是因为有夫妻双方的身体因素而导致的，比如有的会有夫妻双方的染色体异常问题而导致流产，也有的会是女性的生殖道畸形或者是子宫内膜的问题等等影响。
也有的女性可以检查到有血栓前状态或者免疫功能异常，或者有的有血糖高，或者存在各种病毒感染或者是内分泌异常等问题而导致的，也有的是男方的精子异常导致的。