首先非淋菌性尿道炎也是非特异性尿道炎，属于性传播疾病的一种。在男性的主要表现有尿道的刺痛、刺痒、烧灼感、偶尔有少数病人会有尿频尿痛的感觉。查体可以在尿道口发现红肿，分泌物大多数是稀薄的较少，有时候会在早晨起床后发现内裤有污染的情况。如果非特异性尿道炎发生在女性的则主要表现为：白带的增多、宫颈水肿、糜烂。女性的尿道炎常表现为尿道口充血，尿频甚至排尿困难等症状。另外女性沙眼衣原体的感染还可以引起前庭大腺炎、输卵管炎、子宫内膜炎、宫外孕不育症等。