宫腔镜取胚时首先要经阴道扩张宫颈，宫颈口扩开后放置宫腔镜的内窥镜观察宫腔的情况以及胚胎着床的地方，然后在内窥镜的直视下，刮除胚胎组织，再观察胚胎组织是否刮净后退出内窥镜，手术完毕，这个手术过程比较痛苦，可以在静脉麻醉下做无痛取胚术。
宫腔镜下取胚术的优点是可以直视下刮宫，这样就避免了有残留的发生，出现反复刮宫的情况，术中如果出血较多，可给予缩宫素促进子宫收缩止血，术后要用抗生素预防感染。