为了明确引起阴茎小红疙瘩的病变性质，需要做的检查是临床专业查看小红疙瘩的大小、数量以及发红范围，同时观察包皮外观性状。结合外观性状表现，可初步明确常规病菌引起的感染性红色疙瘩。
必要时需要在局部取标本送实验室化验检查，明确致病菌类型。还需要结合不洁性行为史，必要时需要血清病原学检查，明确真菌、滴虫、支原体等具有传染性病原体感染形成的红色疙瘩。
再根据相关检查结果提示，针对性选择敏感抗生素抗炎治疗，即可促使红色小疙瘩消失。