宝宝后半夜咳嗽厉害可能是过敏性因素、支气管炎、反流性食管炎等原因引起。
过敏体质的宝宝夜间睡觉的时候，会造成气道反应性增高，特别是室内如果有过敏的物质存在，受到过敏因素的影响，从而引起过敏性的咳嗽，白天离开室内的过敏原，咳嗽可以缓解。
支气管炎也可引起后半夜咳嗽厉害，是由于细菌或者病毒、支原体感染引起。晚上睡觉的时候，由于分泌物积存在气道内，引起咳嗽加重。反流性食管炎也可导致夜间咳嗽厉害，夜间睡觉平躺的时候，胃的内容物反流到食管，引起刺激性的咳嗽。