治疗肾结石最常见的方法是碎石，因为如果肾结石不能及时排出，会引起反复尿路感染，影响肾功能，不是所有的病人都能用碎石术清除肾结石。
如果是肾脏内比较小的肾结石，可以使用中药排促进结石排出，比如口服排石颗粒、排石冲剂、肾石通胶囊等，较大结石或多发肾结石疗效不佳，它需要用手术来清除结石，建议泌尿外科就诊。
也有部分患者术后或碎石后结石消失，但结石易复发，这时要注意饮食习惯和生活习惯的调整，避免久坐、憋尿、多喝水、勤排尿、吃新鲜蔬菜、水果，同时多进行做剧烈运动，目的是防止结石再次形成，注意半年或一年后复查泌尿系统彩色、多普勒超声，了解是否有结石形成。