治疗肛门湿疹的药膏比较多，对于急性期的肛门湿疹，可以采取醋酸铝湿敷，外用炉甘石洗剂或者硼酸氧化锌软膏。
对于亚急性期的肛门湿疹，可以使用炉甘石或者氧化锌，也可以使用氟氢化可的松软膏。对于慢性期的肛门湿疹，可以使用水杨酸软膏外用。
在治疗期间，患者应该要注意肛门局部的清洁，保持肛门部干燥，避免辛辣刺激性的食物，勤换内衣物。如果经用药等保守治疗，症状仍然比较严重的患者，必要时可以考虑手术治疗。