细菌耐药在临床上也就是指在应用抗生素治疗期间，细菌多次与药物接触后，敏感性有所降低或逐步消失，使得药物对于耐药菌的治疗效果有所下降，就是细菌对抗菌药物产生了耐受性。
细菌耐药性包括获得耐药性以及天然耐药性，临床多以获得耐药性居多，其形成与滥用抗生素息息相关。此时会导致多数敏感菌株不断被杀灭，而耐药的菌株会不断繁殖，久而久之，药物的作用就会有所下降，而天然耐药性与遗传因素有很大关系。
为了确保抗菌药物的有效性，需要在医师的指导下合理应用，不能擅自滥用抗菌药物。