对于病毒性心肌炎的治疗，总体上仍然缺乏有效而特异的手段，以往对本病的治疗多为对症治疗。
国外由于在早期扩张型心肌病的心内膜、心肌活检中，发现很多病例来自于病毒性心肌炎，因而在治疗上也主要着重于这类患者。药物治疗，以针对心力衰竭为主。国内治疗病毒性心肌炎，一般以中西医综合治疗为主，包括抗病毒治疗，免疫调节，及对症处理等等。
总之，病毒性心肌炎的治疗，因不同时期、不同临床表现、不同个体而异，大多数的病毒性心肌炎患者可以治愈。部分可迁延而遗留有各种心律失常，如早搏、房室传导阻滞等等。更为严重的是有可能发生高度或三度房室传导阻滞，患者则需安装永久心脏人工起搏器。少数病毒性心肌炎可急性暴发，以致心力衰竭或猝死。