近亲结婚会增加胎儿的遗传病发病率，因为近亲之间的基因相似度比较高，发病率大约在1%，即使双方没有显性的遗传病，但是由于基因的相似度很高，就会将相同的基因传递给子女，增加孩子的并发率，严重者可导致死亡。
胎儿常出现严重的心脏病、大脑发育不良、脊柱裂以及四肢畸形等病症。
近亲的孩子还可能会出现比如色盲、智力障碍、耳聋以及先天性失明等病症，所以应避免近三代甚至近四代之内进行婚配，否则无论是对家庭还是孩子都是很大的打击，要提倡优生优育，避免出现不必要的麻烦。